Адеш!
У натхов и в тантризме все нади - это проявление «нады» или союза Шивы и Шакти. Главный такой «союз» - это «сушумна», центральный канал. Считается что нада порождает бинду, высшую точку напряжения и потом бинду расщепляется на три уровня и распространяет три уровня «нада»: солнечное, лунное и огненное, которые создают собственно все энергетическое тело. Три уровня соединены внизу (юкта-тривени), каналы, посредством иды и пингалы, соединяются в канде, а также вверху (мукта-тривени), освобожденные три канала или правильней сказать высвобожденная сила этих трех нади. Она высвобождается в брахмарандхру и поэтому условно тексты описывают 1000 лепестков, но на самом деле их бесчисленное количество. В общем-то, все нади - это тело Кундалини-шакти, называемое матрика, т.е. это богини, которых называют матрики, они представлены в других чакрах, которых 49. В общем-то все очень похоже на то, как вы описали, матрики связаны с питхами, и все святые места в Индии спроецированы в человеческое тело. Матрики называют йогинями и у каждой йогини есть мужской двойник - Бхайрава, вместе они символизируют различные уровни соединения (майтхуна). После трех каналов, есть еще девять или четырнадцать, они также связаны с йогинями, девять каналов соответствуют органам восприятия и действия, а также четырнадцать нади связаны с одной из чакр Шри Янтры, которая символизирует собой вселенную, сотворенную Богиней Махатрипура-сундари.
Но если отойти от мифов и вернуться к прикладной стороне, то второстепенные чакры, помимо семи основных, отвечают за различные функции организма, это периферийные нади, которые изначально исходят из основных шести чакр. Когда периферийные чакры в раскрытом состоянии, то активизируются центральные шесть чакр и внутренняя шакти способна пробудиться и подняться вверх. Она может пробудиться только тогда, когда все остальные второстепенные раскрыты. Многие практики йоги направлены на активацию именно этих второстепенных центров, а те техники, которые описаны в главных текстах традиции, как правило, сразу объясняют садханы, связанные с сушумной.