Намасте, Raps!
Вопрос Ваш довольно обширный, в первую очередь потому, что трактовка праны и апаны может различаться в зависимости от традиции, текста и Гуру. Если Вы читали эту тему с самого начала, там Гуруджи Матсьендранатх много пишет о том, как можно рассматривать прану и апану.
Если не усложнять, многие тексты говорят о том, что апана находится в области ниже пупа и имеет тенденции двигаться вниз и наружу, ее соотносят с выделительными процессами в организме, с очищением. Прану часто связывают с дыханием и пребывает она в области груди (и движется вверх). Соответственно, чтобы научиться регулировать прану или апану, можно начать с рассмотрения их физиологических аспектов (потому что аспектов много и если брать все сразу, то можно и запутаться).
На прану можно воздействовать при помощи регуляции дыхания, пранаямы, начиная с самого простого контроля и осознания дыхания и далее включая в практику более сложные методы. Причем, это должно выполняться не только в техническом ключе (типа делаю технически правильно, значит прана регулируется), здесь важно участие вашего восприятия, осознания того, что происходит. Прана - это ведь шакти, энергия, она движется и ее можно почувствовать, и если делать пранаяму не тупо, то можно научиться воспринимать малейшие оттенки и изменения в пране.
Также тут еще нужно учитывать, что человеческий организм - это не изолированная система, он находится во Вселенной, и постоянно взаимодействует с ней, и как бы есть часть всего этого мира (и даже тождественен ему, но пока не об этом речь). Поэтому мы пребываем в постоянном энергообмене с внешней средой, и регуляция праны означает ее контроль, то есть понимания на что вы тратите свою энергию. Здесь прана, конечно, рассматривается в более общем ключе, как энергия в целом (а не только как одна из 5 пран).
Касательно апаны, ее регуляция, на мой взгляд, больше связана с чистотой образа жизни, и с контролем животных инстинктов (еда, секс). Употребление алкоголя, кофе, других интоксикантов, курение в большинстве случаев усиливает апану, иногда это можно использовать и как положительный момент, но чаще всего люди лишь усиливают свое бессознательное состояние и тамас. То есть усиление не всегда благо, нужен баланс, и повышение качества энергии. Некоторые учителя говорят, что апану нужно очищать (т.е. повышать качество), тогда улучшается здоровье, обретается ясность ума и духовная чистота. Для этого рекомендуют уделить внимание питанию (чтобы было саттвичное, легкое, не вызывало гнилостных процессов в кишечнике), контролировать инстинкты, также может помочь медитация на адхары, расположенные в этой области, и практика мудр/бандх, с ними связанная.
Тема большая, может кто-то еще напишет из своего опыта. Тут важны не только книжные знания, нужно еще и осознавать, наблюдать, сопоставлять и тогда многое становится понятнее.